人工合成寡核苷酸探针，是以核苷酸为原料，利用DNA合成仪，人工合成的生物探针，属于核酸探针的一种。从细胞中提取出来的DNA片段，存在高度重复的序列，人工合成寡核苷酸探针根据目的基因设计，避免了这一缺点。
　　人工合成寡核苷酸探针的制作，需要知道目的基因序列，根据目的基因进行设计，合成的探针序列较短，为十几个到几十个核酸片段，与目的基因互补，无需再纯化，复杂度低，且杂交条件与细胞提取DNA探针相同，通常为单链探针，具有组织穿透性好、稳定性好、特异性高、杂交速度快等特点。
　　人工合成寡核苷酸探针经过示踪物标记，与样品中核酸分子进行杂交，当样品中存在与其互补的核酸序列，二者相连形成双链，之后未杂交探针被洗去，通过探针标记物的自显影、发光效果，对人工合成寡核苷酸探针进行检测，进而测定样品中是否含有与人工合成寡核苷酸探针互补的核酸序列。
　　人工合成寡核苷酸探针可以识别目的基因序列中一个碱基的变化，即通过杂交来识别单个碱基突变、单个碱基错配情况；人工合成寡核苷酸探针可以利用酶、荧光染料进行标记；人工合成寡核苷酸探针一次合成可得到大量产品，成本较低。
　　但人工合成寡核苷酸探针的长度必须适中，太长或者太短都会导致杂交过程出现问题；且由于人工合成寡核苷酸探针片段较短，携带的标记物较少，又采用的是非放射性同位素标记，敏感度有限；此外人工合成寡核苷酸探针与mRNA杂交形成的双链，稳定性低于cRNA探针与mRNA形成的双链。
　　核酸探针细分产品主要包括DNA探针、cDNA探针、cRNA探针、人工合成寡核苷酸探针四种，前三种均为克隆产品，而后一种为人工合成产品，更易于大批量生产，因此在生命科学实验、生物医药原料药制备等领域应用广泛。此外，人工合成寡核苷酸探针还可以应用到基因诊断、个体化用药分析等方面。
　　DNA合成仪是自动化合成结构类似DNA或RNA的寡核苷酸的仪器，是人工合成寡核苷酸探针行业的核心上游设备，其设计、研发、生产技术壁垒高。近年来，受生物学、医学、药学等行业快速发展，我国市场对DNA合成仪需求快速增长。目前，我国已经具备DNA合成仪生产能力，但产品品质与进口产品相比存在较大差距，对我国人工合成寡核苷酸探针行业发展造成一定不利影响。